Différences de quantification entre versions 1.5 et 2.0 - Software update https://www.profiproteomics.fr/forum/troubleshooting-update/differences-de-quantification-entre-versions-1-5-et-2-0/ Forum dedicated to Proline Software fr-FR Sat, 13 Jun 2026 18:49:42 +0000 wpForo 60 Différences de quantification entre versions 1.5 et 2.0 https://www.profiproteomics.fr/forum/troubleshooting-update/differences-de-quantification-entre-versions-1-5-et-2-0/#post-157 Wed, 04 Mar 2020 09:56:40 +0000 Bonjour,
je compare les résultats de quantification label-free entre la version 1.5 et la version 2.0 de Proline Studio pour un même set de données et les mêmes identifications. J'ai essayé de définir le maximum de paramètres de la version 2.0 identiques à ceux que j'avais dans la version 1.5 (possibilité de les envoyer). Les résultats d'abondance sont identiques pour une bonne moitié des protéines mais pour les autres on observe un taux de variation entre les 2 versions pouvant aller jusqu'à ± 50%.
Est-il possible d'obtenir les mêmes résultats de quantification entre la version 1.5 et la version 2.0 ? Si oui, comment ? Si non, est-ce lié à des paramètres intrinsèques ?
Merci d'avance.

 

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