Pour une protéine j’ai un statut « invalid typical » que je n’avais jamais vu avant, qu’est-ce que ça signifie ?
Ce nouveau statut vient d'une modification faite au niveau du spectral count :
"Spectral Counting quantitation: Allow to calculate SC values in child dataset even for invalid ProteinSet if these ProteinSet are valid in parent dataset."
En détail, cela signifie que si par exemple une protéine
- a été filtré au niveau d'un dataset fils suite à un filtre: avec 1 peptide spécifique par exemple,
- mais qu'elle apparaît au niveau du dataset de référence : parce qu'elle n'a pas été filtré dans un second fils
alors cette protéine sera présenté dans les 2 dataset fils : dans le premier comme "invalid typical" afin de faire apparaître le fait qu'elle avait été filtré et comme typical (ou sameset/subset selon le cas) dans le second dataset.