Quantification Silac

Bonjour Anne-Aurélie,

En effet, j'ai pu reproduire le problème. Je suppose que pour lancer la quantification, vous cliquez-droit sur l'icone "Quantitations" dans l'arbre du bas à gauche... Par conséquent, on (dans le code de Proline) devrait créer un dataset d'identification de référence. A première vue on a un problème à ce moment-là. Je vais regarder.

En attendant pour contourner le problème, vous pouvez lancer la quantification à partie de l'arbre d'identification (en haut à gauche):

Pour cela, il faut faire un clique-droit sur le dataset à quantifier et choisir "Quantify > Residue Labelling"  dans le menu. Dans ce cas, ce sera le dataset de départ (celui sur lequel vous avez cliquez) qui sera le dataset d'identification de référence.

A noter que c'est parfois préférable d'utiliser ce chemin pour lancer une quantification, notamment lorsque l'on veut partir du travail de validation qui a été réalisé au préalable. Mais c'est surtout pour les quantifications Label Free où plusieurs datasets sont quantifiés...

J'espère avoir répondu à votre problème. Si ce n'est pas clair ou si un autre problème apparait, n'hésitez pas !

Bonne Journée