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compatibilité proline et TimsTof Pro bruker


(@berard)
New Member
Inscription: Il y a 3 ans
Posts: 3
Début du sujet  

Bonjour,

Est ce que proline gère les données PASEF (mobilité ionique) du Qtof Bruker Tims TOF Pro ?

merci pour votre aide

cdt

Yves Berard


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(@vero)
Membre Admin
Inscription: Il y a 4 ans
Posts: 45
 

Bonjour,

Actuellement les données du Tims TOF ne sont pas supportées par Proline mais nous travaillons à leur prise en compte pour une des prochaines versions.

Bonne Journée

Cordialement

Véronique


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(@berard)
New Member
Inscription: Il y a 3 ans
Posts: 3
Début du sujet  

Bonjour

et merci pour votre réponse.

Est ce que Proline gère les données de mobilité issues  (FAIMS) de Thermo ?

cordialement

Yves


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(@david)
Membre Admin
Inscription: Il y a 4 ans
Posts: 6
 

Bonjour Yves,

Au sujet du FAIMS nous n'avons pas encore eu l'occasion de tester de jeux de données acquis avec ce module instrumental additionnel.

Cependant, comme il s'agit d'un système de filtrage placé en amont de l'instrument ceci de ne devrait pas changer le type de données produites par le spectromètre de masse. Donc je dirai qu'en théorie Proline devrait être directement compatible avec des fichiers .RAW acquis avec le module FAIMS.

Concernant les données du Tims TOF nous travaillons sur un convertisseur qui "applatira" la dimension mobilité ionique de façon à produire des fichiers analysable par Proline avec le workflow actuel. Ceci nous laissera du temps pour mettre au point des workflows tirant parti de cette dimension supplémentaire.

Cordialement,

David


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(@berard)
New Member
Inscription: Il y a 3 ans
Posts: 3
Début du sujet  

Bonjour David

Et merci beaucoup pour votre réponse

yves

 


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 Yves
(@yves)
New Member
Inscription: Il y a 1 an
Posts: 2
 

Bonjour,

Est ce que Proline est compatible avec les données issues du TimsTof Pro de Bruker ?

Existe t-il un mzDB converter spécifique ou peut-on éventuellement utiliser un mzDB converter classique  (=identique à celui utilisé pour les données du Qtof Bruker type Maxis II) quitte à "perdre " la donnée correspondant à la mobilité ionique ?

Merci pour votre aide

Cordialement

yves berard- sanofi pasteur


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 Yves
(@yves)
New Member
Inscription: Il y a 1 an
Posts: 2
 

Bonjour,

Est ce que Proline est maintenant compatible avec les données issues du TimsTof Pro de Bruker ?

Existe t-il un mzDB converter spécifique ou peut-on éventuellement utiliser un mzDB converter classique  (=identique à celui utilisé pour les données du Qtof Bruker type Maxis II) quitte à "perdre " la donnée correspondant à la mobilité ionique ?

Merci pour votre aide

Cordialement

yves berard- sanofi pasteur


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(@david)
Membre Admin
Inscription: Il y a 4 ans
Posts: 6
 

@yves

Bonjour Yves,

 

Nous travaillons actuellement sur une solution de ce type.

Nous avons un prototype mais il n'est pas encore finalisé.

Nous mettrons un message sur ce fil de discussion lorsque nous aurons une version stable à partager.

 

A bientôt,

 

David


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